Версия для слабовидящих
Профессор МГУ о конкурсе по решению важнейшей задачи для клеточной биологии Печать Email
Новости об инновациях
21.01.2014

Трассирование частиц является не до конца решенной проблемой. Трассирование частиц является не до конца решенной проблемой.

Профессор МГУ Яннис Калайдзидис рассказал о подробностях конкурса на лучший метод решения важнейшей задачи для клеточной биологии, которая имеет приложение к поиску лекарств для ряда болезней (в том числе таких, как болезни Альцгеймера и Паркинсона), — трассирования частиц, то есть одновременного отслеживания движения сотен-тысяч внутриклеточных органелл, вирусов или молекул.

В журнале Nature Methods в ночь на понедельник по московскому времени опубликована статья, речь в которой идет не об открытии или каком-то другом научном достижении того же рода, а о результатах конкурса научных методов.

В ходе мероприятия требовалось найти наиболее верный подход к некой научной проблеме, со своими предложениями в конкурсе участвовало 14 исследовательских групп со всего мира. Авторами статьи являются участники конкурса, ведущими авторами публикации — его организаторы. Подготовка статьи заняла чуть больше года: принята к публикации она была в декабре 2013-го.

Суть научной проблемы же была сформулирована в мае 2012 года в Барселоне на Международном симпозиуме по биомедицинским Изображениям (IEEE International Symposium on Biomedical Imaging — ISBI'2012).

«В микроскопии живых клеток одновременное отслеживание движения от сотен до тысяч внутриклеточных органелл, вирусов или отдельных флуоресцентных молекул — трассирование — является не до конца решенной проблемой, — говорит один из участников конкурса Яннис Калайдзидис, профессор факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ, сотрудник Института молекулярной клеточной биологии и генетики общества Макса Планка в Дрездене».

Калайдзидис на конкурсе представлял свою программу MotionTracking, разработанную в части трассирования внутриклеточных органелл в 2001–2004 годах и представленную в 2005 году в журнале Cell.

Внутри клеток имеется большое количество везикулярного транспорта (везикулы — мелкие внутриклеточные образования, своеобразные сумки, защищенные мембранами, в которых запасаются или транспортируются питательные вещества, сигнальные молекулы и используются, например, вирусами и микобактериями для проникновения в клетку), и нарушение транспорта этих везикул приводит к целому спектру заболеваний.

Кроме нарушения метаболизма, это и нейродегенеративные заболевания, в первую очередь болезни Альцгеймера и Паркинсона, и многие наследственные заболевания, проявляющиеся в старческом возрасте.

Отслеживать этот транспорт очень важно, для чего везикулы маркируют, а потом отслеживают (трассируют) их продвижение с помощью микроскопа. Раньше этот процесс проводился учеными вручную. Но сейчас, как правило, при научных исследованиях речь идет не о десятках, а о сотнях или тысячах частиц, и ручное трассирование становится очень проблематичным. Здесь уже понадобились компьютеры и численные методы оценки. Таких методов много, практически по одному на каждую заинтересованную группу, и, чтобы понять, какой метод эффективнее, организаторы конкурса взяли набор искусственно сгенерированных временных серий фотографий с транспортом частиц и предложили конкурсантам провести собственные трассирования, чтобы потом сравнить их результаты с «ответом в конце задачника».

Конкурс, собственно, закончился ничем, явный победитель так и не был выявлен.

Пока все осталось по Киплингу, который в одном из своих произведений сказал:

«Есть шестьдесят девять способов писать песни племен. И каждый из них правильный!» (There are nine and sixty ways of constructing tribal lays, And every single one of them is right!, «In the Neolithic Age», Stanza 5, 1895).

В данном случае, если точнее, одинаково правильный.

По мнению Калайдзидиса, неудача объясняется главным образом сложностью задачи. Одновременно недостатком, который следует исправить в будущих конкурсах, является чрезмерная «упрощенность тестовых изображений», которая может привести к тому, что победители могут оказаться не лучшим выбором при анализе реальных изображений.

В то же время организаторы правильно указывают: невозможность безошибочно трассировать даже такие упрощенные изображения показывает, что проблема до сих пор не решена и требует дальнейшей работы.

«Эта упрощенность, — говорит Калайдзидис, — привела к недооценке ряда реальных проблем, возникающих в прикладной количественной микроскопии, и, как следствие, потенциальному перекосу в сторону алгоритмов, специфически разработанных для конкурса».

Источник - http://www.nanonewsnet.ru/articles/2014/professor-mgu-o-konkurse-po-resheniyu-vazhneishei-zadachi-dlya-kletochnoi-biologii-0

 
Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта
incest xxx free rarefilm.net