опубликованы в журнале Nature....

" /> Обнаружен новый эпигенетический маркер мРНК Версия для слабовидящих
Обнаружен новый эпигенетический маркер мРНК Печать Email
Новости об инновациях
26.02.2016

Американские и израильские исследователи обнаружили новый путь метилирования матричной РНК (мРНК), который служит эпигенетическим маркером, регулирующим экспрессию генов. Результаты работы опубликованы в журнале Nature.

Речь идет о мРНК с аденозином, метилированным по атому азота в первом положении (N1-метиладенозином, m1А). Он необычен тем, что при нормальном рН имеет положительный заряд (остальные азотистые основания не заряжены) и не может образовывать комплементарные связи. Наличие m1А было показано в транспортной РНК (тРНК), где он необходим для формирования правильной третичной структуры молекулы. В мРНК и ДНК такое метилирование наблюдалось под действием алкилирующих агентов и свидетельствовало о повреждении этих нуклеиновых кислот. Изучение m1А затруднено, поскольку в щелочных условиях он путем перегруппировки Димрота преобразуется в широко распространенный эпигенетический маркер N6-метиладенозин (m6А).

Нумерация атомов в молекуле аденина. Pepemonbu / Wikimedia Commons

Ученые из Чикаго, Тель-Авива и Рамат-Гана разработали метод стабилизации, который снижает уровень преобразования в m6А до менее чем 10 процентов. Они также использовали радиоактивную маркировку при проведении масс-спектрометрии, что позволило им провести количественный анализm1А во всей клетке и выяснить ее расположение в молекуле мРНК.

Оказалось, что, хотя m1Австречается в разы меньше, чем m6А, он присутствует в тысячах транскриптов. Причем в большинстве молекул мРНК он встречается только в участках, богатых гуанином и цитозином и связанных с термодинамической стабильностью вторичной структуры макромолекулы. Дальнейший анализ показал, что доля содержащей m1А мРНК коррелирует с уровнем экспрессии генов. Крометого, такая мРНК отличается большим числом участков,инициирующих альтернативную трансляцию. В итоге метилированная мРНК производит в 1,7 раза больше белка, чем не метилированная.

Эксперименты на культурах клеток показали, что в различных стрессовых условиях уровень m1А может меняться. То есть этот нуклеотид является динамической модификацией, играющей роль в ответе на стресс и клеточные сигнальные процессы.

Полученные данные позволяют предположить, что m1А может являться как следствием повреждения мРНК алкилирующими агентами, так и полезным эпигенетическим маркером в зависимости от его расположения в молекуле, отмечают стэнфордские химики Анна Кетрис (Anna Kietrys) и Эрик Кул (Eric Kool), не принимавшие участия в исследовании.

Эпигенетическая регуляция фенотипа не затрагивает нуклеотидные последовательности генов, влияя лишь на их экспрессию. Она может происходить путем метилирования нуклеиновых кислот, модификации белков-гистонови некоторыми другими способами.

Автор: Олег Лищук

Источник - http://www.nanonewsnet.ru/news/2016/obnaruzhen-novyi-epigeneticheskii-marker-mrnk

 
Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта