Версия для слабовидящих
Новое об опухолевом супрессоре р53 Печать Email
Новости об инновациях
02.12.2014

Ученые Национальной лаборатории имени Лоренса в Беркли (Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley Lab) выяснили новые детали связывания опухолевого супрессора белка р53 с геномом человека. Как и во многих других случаях, когда речь идет о жизни, установили исследователи, многое здесь зависит от «контекста».

1_453.jpg Иллюстрация связывание р53 с основными
категориями повторов генома человека –
LTR, SINE и LINE. (Рис. Berkeley Lab)

Исследователи картировали связывание р53 с геномом клеток человеческой раковой линии и сравнили эту карту с составленной ранее, отражающей сайты связывания р53 в здоровых клетках. Эти паттерны связывания показывают, как белок мобилизует сеть генов, подавляющих опухолевый рост.

Они установили, что р53 взаимодействует с различными типами последовательностей ДНК, среди которых есть последовательности, представленные многими копиями и в разных частях генома. Эти последовательности, называемые повторами, составляют около половины нашего генома, но их функция понимается учеными в значительно меньшей степени, чем функция так называемой уникальной ДНК (англ. single-copy DNA).

Тот факт, что белок р53 связывается с повторами, известен давно, но ученые из Berkeley Lab открыли кое-что новое: в раковых клетках этот белок встречается у повторов гораздо чаще, чем в нормальных. Паттерны связывания в клетках этих линий очень различны, несмотря на одни и те же экспериментальные условия. Это свидетельствует о том, пришли к выводу исследователи, что в ответ на один и тот же стрессовый сигнал р53 связывается с человеческим геномом селективно и в зависимости от клеточного контекста – идея, остававшаяся неподтвержденной в течение многих лет.

«Точно установлено, что р53 регулирует определенные наборы генов в зависимости от типа клетки и типа повреждения ДНК. Но как эта специфичность достигается и связывается ли р53 с геномом селективно, оставалось предметом дискуссий. Мы показали, что связывание р53 действительно является селективным и зависимым от контекста», – говорит автор исследования Крассимира Ботчева (Krassimira Botcheva).

В этой работе она сотрудничала с Шоном Мак-Корклом (Sean McCorkle) из Брукхейвенской национальной лаборатории (Brookhaven National Laboratory).

Что конкретно означает в этом случае клеточный контекст? Составляющая геном ДНК организована в хроматин, который, в свою очередь, упакован в хромосомы. Клетки разных типов отличаются состоянием хроматина. Рак может изменять хроматин, не оказывая влияния на последовательности ДНК – тип изменений, называемый эпигенетическим. Новое исследование показывает, что эпигенетические изменения хроматина могут оказывать большое влияние на функцию р53.

«Чтобы понять функции р53 как опухолевого супрессора, зависящие от связывания с ДНК, нам нужно изучить эти функции в контексте динамических ассоциированных с раком эпигенетических изменений», – подчеркивает Ботчева.

Эти данные – самые современные представления о р53, одном из наиболее изученных человеческих белков. За последние 35 лет ученые многое узнали о том, как этот белок борется с раком: после повреждения ДНК р53 может инициировать остановку клеточного цикла, чтобы дать клетке время для репарации ДНК; может стимулировать сенесценцию, останавливающую пролиферацию клетки; может быть триггером гибели клетки, если повреждение ДНК слишком серьезно.

Большая часть исследований по р53 сфокусирована на связывании этого белка с уникальной ДНК, где находятся гены. Работа ученых из Berkeley Lab показывает, что серьезного внимания заслуживают и повторы.

«Наше исследование демонстрирует, что связывание р53 с повторами может иметь важнейшее значение для поддержания стабильности генома», – считает Ботчева. «Повторы могут оказывать значительное влияние на то, как вся сеть р53 мобилизуется для гарантированного подавления опухоли».

Статья об исследовании Cell Context Dependent p53 Genome-Wide Binding Patterns and Enrichment at Repeats опубликована в журнале PLOS ONE.

Источник - http://www.nanonewsnet.ru/news/2014/novoe-ob-opukholevom-supressore-r53

 

Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта Карта сайта